1、用于组织切片、生物材料荧光标记、活细胞荧光标记的高分辨率成像，并且可以得到清晰锐利的多层Z平面结构，即光学切片，并以此可以构建标本的三维实体结构，用作形态分析和三维空间测量。

2、用于活细胞生物分子、细胞器或离子等生物物质的定性、定量、定时和定位分布检测等，适合用于快速变化样品，捕捉变化过程信号，可监测细胞内钠镁钙离子浓度变化，捕捉钙火花，并且缩短实验时间，降低光毒性。

3、用于获取图像的时间信息，研究荧光标本随时间浓度、强度、扩散速度、空间移动等变化的数据信息，进行相关动力学研究。

4、可对样本进行光谱扫描，获取荧光标本光谱信息，研究荧光材料光谱特性、获取未知染料发射光谱图。